方以智听了朱由检的话后，一时不知道该怎么说才好。
但他还是不甘心，不甘心大量士子流放偏远之地。
于是，方以智只得强行解释道：“陛下容禀！士族固有自私之处，以致当时拒绝陛下南迁，险使陛下处于险境！然当时的确是没有料到李自成会迅速攻陷江南，也的确只是担心陛下来南京，会滋扰江南士民！”
“非江南士民不忠于陛下，如今陛下因此记恨于江南士民，是江南士民应有之罪，如今陛下也显示了雷霆手段，臣等江南士族也知道了何为帝王之怒！”
“故请陛下放过我等士族，以宽仁治国，饶恕我江南子民之违逆之罪！”
“臣保证，以后江南士族必不再为难陛下，陛下要禁止私人结社，我们可以不结社，陛下要追缴欠税，我们可以补缴税银，陛下要去南京，哪怕是去苏州，杭州，我们也不再阻拦，并恭迎陛下巡幸江南各地，只求陛下能再施恩于我江南士民！”
方以智说完就再次跪拜在朱由检面前。
为了能让被流放的大量士族子弟回来，为了能让皇帝陛下与江南士族握手言和，他甘愿放低姿态。
但朱由检只是淡淡一笑：“早知今日何必当初。”
接着，朱由检又道：“不过，朕得纠正你一句话，江南是朕的江南，不是你们江南士族的，朕去不去江南，从来不是你们江南士族可以说了算的，所以，你言语上有错误，你不应该说是你们以后允许朕来江南，朕去不去江南不需要你们允许，另外，补缴税赋是为大明臣民的本分，为国民众者，有两件义务必须履行，一是做活，二是缴税。”
方以智听朱由检这么说，再次哑口无言。
这时候。
张慎言不由得说了起来：“陛下，江南士族固有冒渎圣威之处，如今得此磨难，也是应有之罚，然臣想说，陛下为何置南安伯郑芝龙其部违法乱纪之事于不顾，我江南士族虽有得罪陛下之处，然江南庶民并无可恨之处！”
朱由检看了他一眼，道：“且不说朕现在还没有掌握到他们郑家掠民的证据，如今只是你们的风闻之事，就算郑家真的掠民，你们觉得朕现在能把他郑家怎么样？你们江南士族为谋走私之利，暗中勾结郑氏，使其日渐做大，如今已成富可敌国的海上霸主，朕哪里能奈何得了他们，能以朝廷之势，震慑住他且让其为朝廷做事已经属于大不易了！”
张慎言听朱由检这么说更加无法回答。
而方以智这时候却越想越气愤，因为他没想到他和张慎言信誓旦旦不畏生死的跪着求见皇帝，却被皇帝说的体无完肤。
所以，方以智不由得再次大胆说道：“陛下，臣再次斗胆启奏，想必陛下已经知道江南士子已有罢考之论，难道陛下真的不担心如此严酷对待我江南士族，而使得朝廷科考无应试之人，大明再无可用之文官，使得朝廷无法运转吗？！”
朱由检笑了起来：“如果你江南士族子弟真的全部罢考，朕还真的有些担心整个大明运转不过来，毕竟天下的确需要你们读书人来治理，因为朕的兴明会人数还不多，还只能维系淮北与河南、山东部分地区的治理，而且还很捉襟见肘！”
“但是，朕相信任何一个人都有自己的文化属性，任何一个群体也就有自己的本质，你们士族的本质是自私且懦弱还趋利避害的，换言之，他们都是聪明人，朕相信他们不会放着可以富贵一生的官不去做，而真的能恪守清贫闭门读书一辈子！”