因袁绍对宦官的大清洗，内廷服务人员严重不足，朝堂诏令以公卿以下子弟为郎官，颇有质子之意。
之后是董卓力主的几个重磅任命：
以太尉刘虞为大司马位比上公，加一千五百户，董卓转任太尉兼前将军，封郿侯，相比传统的太尉，增加了节传、斧钺、虎贲，加上原本任太傅的袁隗，这三人是上公。
以太中大夫杨彪为司空，豫州牧黄琬为司徒，这两人是传统意义上的三公。
关东袁隗、刘虞两个上公，加司徒黄琬；关西董卓一个上公，加司空杨彪。从人数上讲关东还占一点优势。司徒黄琬主管民政、税收、上计等工作，比主管建设水土事的司空杨彪也更有实权。可见董卓虽然在废立等问题上显示出无理和蛮横，表面上依然对世家、名士、重臣尽量表达出善意。
当然，刘虞并不在朝中，无法对雒阳产生足够的影响，袁隗的太傅遇到董卓的太尉，如同秀才遇到兵有理说不清，铁打的董卓、袁隗，流水的三公，董卓才是把持朝政那个--虽然他不太懂。
为了尽量继承何进的政治遗产、取得世族、党人的理解和支持，董卓践行了一早的诺言，请示皇帝后，联合太傅袁隗、司空黄琬、司徒杨彪，正式给陈蕃、窦武等两次党锢之乱的受害者平反，恢复他们的爵位，征辟他们的子孙。
同时，为了给平反者在朝堂留出足够的位置，在袁隗、杨彪、黄琬、周毖、伍琼等人建议下，董卓将一批表现的比较恭敬、颇有威望的朝中名臣，外放地方：如尚书颍川韩馥为冀州刺史、侍中东莱刘岱为兖州刺史、陈留孔伷为豫州刺史，名为刺史，官秩皆两千石。
刘备提出想外放青州刺史，因为全国连续大雨，青州黄巾再次复起事，焦和在青州表现的并不好，本来很有希望。但袁隗因为焦和是名士和袁门故吏，立主保留焦和的位置，让刘备大为郁闷。
接着是郡守国相，原兖州刺史乔瑁为东郡太守，张咨为南阳太守。。。白波贼与于夫罗联兵，侵犯河东，董卓遂以女婿牛辅为河东太守，讨伐之。
此时，刘备退而求其次，请以卢植为带方太守，卢植名声高远、文才武略，董卓担心卢植割据海外，毫不犹豫的拒绝了，于是任命卢植为东莱太守，将原东莱太守袁遗调兖州山阳，山阳太守刘洪调带方。
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大多数官员都是平调动或升职，唯有董卓的红人虎贲中郎将孔融从距离皇帝最近的地方发配到黄巾肆虐的北海，令人费解。
董卓原本对刚正敢说实话孔融极为信重，前几天一件事大大恶化了他们的关系。
为解决财政缺口和军费，董卓将孝灵皇帝西园中的财宝权全部纳入自己麾下，又派御史调查雒阳的达官贵人，有错的都派军队入室搜刮。他手下士卒多从贫穷的地方招募来，见了金钱，眼睛红，见到女人，眼睛绿，往往拔高罪名，抢走数倍数十倍的财货，掠夺美貌女子为妻妾。
蔡邕、孔融都坚决反对，被批评的次数多了，董卓也能严加管教，但多数时候，睁一只眼闭一只眼，只要不弄出人命来都放任。
世家豪族们因此怨声载道，恨之入骨。孔融出生世家，耻于与董卓为伍，申请辞职。